PlanCare
PlantCARE 元件库扫描
用 PlantCARE 元件库在启动子序列中检索顺式作用元件，双链扫描，结果可导出为 8 列制表符表格。
- 元件库按 PlantCARE 命名与写法整理，覆盖光响应、激素、逆境、发育与核心启动子
- 位置统一记正链 1 基坐标，负链命中取分数较高的一侧
- score 为逐位一致碱基数，只在同长度元件之间可比
PlantCARE：72 条记录、61 个元件名。PlantCARE 官方站已下线，本库为按元件命名、共识序列与功能描述整理的子集。
提交序列
预设
已提交
类别分布
元件命中排行 前 20
| 元件 | 类别 | 命中 | 占比 |
|---|
序列元件分布
命中明细
| 序列 | 元件 | 位置 | score | 链 | 共识序列 | 类别 | 功能 |
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逐序列统计
| 序列 | 长度 | 命中位点 |
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结果说明
- 元件类别与子类是按功能描述做的关键词启发式归类，不是 PlantCARE 原有字段。
- score 为位点与共识序列逐位一致的个数，只在同长度元件内部可比，跨元件比较无意义。
- 互为反向互补的成对条目（如 CGTCA-motif 与 TGACG-motif）会在同一坐标同时出现，属正常现象。
输出为 8 列制表符表：序列ID、元件名、共识序列、位置、score、链、物种、功能。位置是正链 1 基坐标，负链命中同样记正链坐标。