New Place
newPLACE 元件库扫描
用 newPLACE 30.0 元件库扫描启动子序列，保留原始功能描述，适合做元件分布与统计。
- 元件库为 newPLACE 30.0 全量数据，469 条记录，含物种与完整功能描述
- 共识序列支持 IUPAC 简并码、小写弱保守位点与括号并列写法
- 短元件噪声明显，建议同时设置长度下限与 score 下限
newPLACE 30.0：469 条记录、469 个元件名。newPLACE 原站域名已失效，本库由存档的 place_dat 与 place_seq 复原。
提交序列
预设
已提交
类别分布
元件命中排行 前 20
| 元件 | 类别 | 命中 | 占比 |
|---|
序列元件分布
命中明细
| 序列 | 元件 | 位置 | score | 链 | 共识序列 | 类别 | 功能 |
|---|
逐序列统计
| 序列 | 长度 | 命中位点 |
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结果说明
- 元件类别与子类是按描述关键词做的启发式归类，不是数据库原有字段，请以元件名与描述为准。
- score 为逐位一致碱基数，4 到 6bp 的短元件在任意 2kb 序列上都会命中多处，请用长度下限与 score 下限压噪。
- 结果中的共识序列是该元件的原始写法，不是实际命中序列。
输出为 8 列制表符表：序列ID、元件名、共识序列、位置、score、链、物种、功能。位置是正链 1 基坐标，负链命中同样记正链坐标。